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Bioinformatikerin / Bioinformatiker (m/w/d), Medizinische Fakult?t

An der Medizinischen Fakult?t der Universit?t Augsburg suchen wir am Lehrstuhl für die Erforschung umweltbezogener Wirkmechanismen auf die Gesundheit zur Verst?rkung unseres interdisziplin?ren Forschungsteams zum n?chstm?glichen Zeitpunkt eine/einen

Bioinformatikerin / Bioinformatiker (m/w/d)

mit fundierter methodischer Expertise im Bereich Mikrobiomanalyse, multivariater
Statistik und Machine Learning

im Umfang der H?lfte der regelm??igen Arbeitszeit in einem auf vier Jahre befristeten Besch?ftigungsverh?ltnis. Diese Stelle ist im Rahmen des Projekts BIOMEX (Integrative Bioinformatik zur Ableitung von Risikoprofilen und Pr?ventionsstrategien entlang der Darm-Gehirn-Achse) zu besetzen. Die Vergütung erfolgt bei Vorliegen der pers?nlichen und tariflichen Voraussetzungen nach Entgeltgruppe 13 TV-L.

Die neu eingerichtete Professur ?für die Erforschung umweltbezogener Wirkmechanismen auf die Gesundheit (Exposomforschung)“ an der Medizinischen Fakult?t der Universit?t Augsburg ist Teil des stark wachsenden Forschungsschwerpunkts Environmental Health Sciences (EHS). Sie befasst sich mit der Erforschung, Erkennung und Pr?vention umwelt- und ern?hrungsbedingter Gesundheitsrisiken. Ein starker Fokus der Professur liegt darin zu verstehen, wie nachhaltige, gesunde Ern?hrungsformen und ihre bioaktiven Bestandteile effektiv genutzt werden k?nnen, um ein gesundes Altern zu erm?glichen und den gesundheitlichen Auswirkungen des Klimawandels auf den Menschen entgegenzuwirken. Hier kooperieren wir national und international mit verschiedenen Disziplinen und setzen als Teil eines multidisziplin?ren Expertenteams an der Universit?t Augsburg zus?tzliche, neue Impulse in der studentischen Lehre im gro?en Kontext von ?Mensch, Klima und Umwelt“.

Ihre Aufgaben:

  • Qualit?tskontrolle, Aufbereitung und Analyse von Shotgun-Metagenomdaten sowie Exposomdaten, v. a. chemical Exposomics
  • Erstellung von Mikrobiom-Diversit?ts- und Funktionsprofilen
  • Integration biologischer Marker (z.?B. Leaky-Gut-Parameter) mit klinischen und ern?hrungsbezogenen Daten
  • Durchführung multivariater Clusteranalysen und Machine-Learning-Verfahren zur Subgruppenbildung
  • Anwendung erkl?rbarer KI-Modelle (z.?B. Random Forest, SHAP)
  • Visualisierung und Dokumentation der Ergebnisse für wissenschaftliche Publikationen
  • Zusammenarbeit mit interdisziplin?ren Teams aus Medizin & Grundlagenwissenschaft

Ihr Profil:

  • Abgeschlossenes Studium in Bioinformatik, Datenwissenschaft, Biostatistik oder verwandten Bereichen
  • Erfahrung in der Analyse metagenomischer Daten sowie Exposomdaten aus dem humanen Kontext
  • Kenntnisse in Statistik, Clustering und Machine Learning (z.?B. PCA, Random Forest, k-Means)
  • Sicherer Umgang mit Python und/oder R
  • Strukturierte, eigenst?ndige Arbeitsweise und gute Teamf?higkeit
  • gute Deutsch- sowie Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Die erforderliche Qualifikation ist bereits in den Bewerbungsunterlagen durch entsprechende Zeugnisse nachzuweisen.

Wir bieten:

  • Mitarbeit in innovativen, interdisziplin?ren Forschungsprojekten
  • Einbindung in ein engagiertes wissenschaftliches Team
  • M?glichkeit zur Mitwirkung an Publikationen und Pr?sentationen
  • Zugang zu moderner Recheninfrastruktur und bioinformatischen Ressourcen
  • Die M?glichkeit zur Habilitation ist gegeben

Bewerbung & Kontakt:

Bitte senden Sie Ihre Bewerbungsunterlagen (Motivationsschreiben, Lebenslauf, Zeugnisse, Publikationsliste) in Form einer einzigen PDF-Datei mit dem Betreff ?Bewerbung als Bioinformatiker*in“ bis sp?testens

28. Januar 2026

an Prof. Dr. Evelyn Lamy, E-Mail:? exposom-stellen@med.uni-augsburg.de

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